Het orgel is in 1868 geplaatst door de Amsterdamse orgelbouwers Flaes en Brünjes. De rente en aflossing voor de benodigde lening van fl. 3085,- werd – net als de bouw van de pastorie en de aanschaf voor een tweetal kroonluchters – bekostigd vanuit de armenkas, de ‘bos’- of ‘buulkist’ (zie de tekst “in de oude raadzaal”).
Het origine Flaes en Brünjes-orgel is tussen 1981 en 1983 gerestaureerd door de firma Flentrop, waarbij onder andere de intonatie zoveel mogelijk in de oorspronkelijke staat is gereconstrueerd.
Frits Mehrtens (1922-1975) groeide uit tot een van de bekendste kerkmusici van ons land. Reeds op zijn negende het orgel in Beets bespelend, zou hij later vanuit dit godshuis samenzangdiensten voor NCRV en IKON verzorgen, die landelijk voor radio en tv werden uitgezonden. Hij werd de drijvende kracht achter de vernieuwing van onze kerkmuziek.
